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정밀의료

Cancer-Prime™

CancerPrime

Cancer-PRIME™ (제품)

Cancer-PRIME™의 DNA Panel KIT는 클리노믹스가 자체적으로 개발한 Panel Sequencing Kit로 Tissue(FFPE), ctDNA(cell-free DNA), ctcDNA(Circulating tumor cell’s DNA)를 amplification 방식으로 target gene 부분을 enrichment하여 rare allele frequency로 sequencing이 가능합니다.
ctDNA (circulating tumor DNA), cfDNA (cell-free DNA), FFPE 샘플 등이 1~10ng의 극소량만 있어도 sequencing이 가능한 kit입니다. 51개의 actionable gene을 1% LOD (Limit of Detection)로 유전변이 검출이 가능합니다.

Benefits

    Access a Wide Range of Samples
  • Process multiple starting sample types including whole blood, fractionated blood, dissociated tissue, and cell cultures.
  • Use Your Own Capture Criteria
  • Capture cells using single or multiple capture antibodies. Use pre-validated or user-defined kits.
  • Capture Intact, Pure Cells
  • Recover target cells with high yield and purity using minimal processing.
  • Minimize Sample Dilution
  • Gain immediate access to highly concentrated, low-volume samples ready for molecular and cell-based analysis.
  • Save Time
  • Increase your lab’s productivity with the IsoFlux System. Requires minimal handson time and fits into standard laboratory workflows.
  • Save Space
  • Easily fit the IsoFlux system in your laboratory with its small, benchtop footprint.
  • Utilize Validated CTC Analysis Workflows
  • Analyze your samples with confidence utilizing Fluxion’s validated sample-to-answer workflows. Analysis modalities include enumeration, mutation detection, gene expression, FISH, and more.

Cancer-PRIME™ (서비스)

클리노믹스의 Cancer-PRIME™ 서비스는 NGS technology (차세대 염기서열 분석) 를 이용하여 각종 암에 관련된 다수의 유전 변이를 검출하고 나아가 Bioinformatics (생물 정보 처리) 을 통하여 분석 결과와 관련된 치료제 (항암제) 정보까지 제공하는 암유전자 분석 서비스 입니다.
Cancer-PRIME™ 서비스는 국내 외 데이터베이스 기반으로 선정된 Hotspot 영역과 FDA 승인 또는 임상실험 진행 중인 항암제와 관련된 gene을 대상으로 하며, 암 발생의 원인 유전자를 규명하고 개인 맞춤 치료를 위한 유용한 정보를 제공할 수 있습니다.

특장점

확실함 Liquid biopsy 샘플 (cfDNA, circulating tumor cells) 및 FFPE 샘플에서 ctcDNA (enriched CTCs 의 DNA), cfDNA 의 rare allele frequency 에서도 유전 변이를 확실하게 규명할 수 있습니다.
리포트 SNVs (Single Nucleotide Variants), Indels (Insertions and Deletions), CNVs (Copy Number Variations, Liver Cancer-PRIME™ 제외)를 포함하는 변이를 한 번에 분석 가능하며, 해당 변이에 대한 분석 결과를 report 하여 제공해 드립니다.
극소량 10 ng 의 극소량 DNA 로도 분석이 가능합니다.
경제적 적은 DNA 양에도 최적화된 Targeted sequencing은 경제적인 비용으로 빠르고 정확한 유전체 분석 서비스를 제공합니다.

Workflow

Workflow

Wor서비스 가이드라인kflow

서비스 가이드라인

세부 상품 리스트

Actionable Cancer-Prime™ Liver Cancer-Prime™ Gynecologic Cancer-Prime™

Actionable Cancer-PRIMEe™

- Actionable Cancer-PRIME™ panel은 51개의 actionable gene을 분석합니다.
- 51개 Actionable gene 은 27개 Full CDS (Coding Sequence)와 24개의 Hotspot 영역을 표적으로 screening 합니다.
- 1% 의 LOD (Limit Of Detection) 로 유전 변이의 검출이 가능합니다. (with 94 % sensitivity and 99% specificity)
- 51개 유전자에 대하여 SNVs (Single Nucleotide Variants), Indels (Insertions and Deletions), MNP (Multi Nucleotide Polymorphism) 정보를 모두 제공해 드립니다.
- 그 중 27개의 유전자에 대해선 CNVs (Copy Number Variations) 분석 결과도 제공해 드립니다.

제품 상세 설명

Feature Sepecification
Targets Exons within 51 Actionable Genes
Total Target Size 136.75 kb
Primer Pool Size 1,355 Primer pairs in 2 tubes
Amplicon Length 125 ~ 175 bp (Average 155 bp)
Input DNA Required 1 ~ 10ng DNA sample
Starting Sample FFPE, CTC, cell-free DNA
Sample Multiplexing Ion 540 Chip: 32 samples, ~ 1,000x average coverage
Ion 540 Chip: 8 samples, ~ 5,000x average coverage
Coverage Uniformitya > 95 %
On Target Percentageb > 95 %
Limit of Detectionc 1 % (10ng input, 1,000 depth )

a : base covered at >20% of the mean coverage b : bases mapped to target regions, out of total mapped bases per run c : Tested with Horizon Multiplex I cfDNA Reference Standard Set

Liver Cancer-PRIME™

- Liver Cancer-PRIME™ panel은 58개의 Liver gene을 분석합니다.
- 58개의 Hotspot 영역을 표적 Screening 합니다.
- 0.1%의 LOD (Limit Of Detection)로 유전 변이의 검출이 가능합니다.
- 58개 유전자에 대하여 SNVs (Single Nucleotide Variants), Indels (Insertions and Deletions)분석 결과를 제공해 드립니다. (Liver Cancer-PRIME™ 에서 CNVs 분석은 제외됩니다.)

제품 상세 설명

Feature Sepecification
Targets Hotspot mutation within 58 genes
Total Target Size 35.61 kb
Primer Pool Size 406 Primer pairs in 1 tubes
Amplicon Length 125 ~ 140 bp
Input DNA Required 1 ~ 10ng DNA sample
Starting Sample CTC, FFPE, cell-free DNA
Sample Multiplexing Ion 540 Chip: 60 samples , ~1,000x average coverage
Ion 540 Chip: 30 samples , ~5,000x average coverage
Coverage Uniformitya > 95 %
On Target Percentageb > 95 %
Limit of Detectionc 0.1% (10ng input, 5,000X depth)

a : base covered at >20% of the mean coverage b : bases mapped to target regions, out of total mapped bases per run c : Tested with Horizon Multiplex I cfDNA Reference Standard Set

Gynecologic Cancer-PRIME™(부인암)

- Gynecologic Cancer-PRIME™ panel은 24개의 Gynecologic gene을 분석합니다.
- 20개 Full CDS (Coding Sequence) + 4개의 Hotspot 영역을 target 합니다.
- 0.1%의 LOD (Limit Of Detection) 로 유전 변이의 검출이 가능합니다.
- 24개 유전자에 대한 SNVs (Single Nucleotide Variants), Indels (Insertions and Deletions) 과 20개 유전자에 대한 CNVs (Copy Number Variations) 분석 결과를 제공해 드립니다.

제품 상세 설명

Feature Sepecification
Targets Exons and Hotspot mutations within 24 genes
Total Target Size 169.34 kb
Primer Pool Size 2,265 primer pairs in 2 tubes
Amplicon Length 125 ~ 140 bp
Input DNA Required 1 ~ 10ng DNA sample
Starting Sample CTC, FFPE, cell-free DNA
Sample Multiplexing Ion 540 Chip: 60 samples , ~1,000x average coverage
Ion 540 Chip: 30 samples , ~5,000x average coverage
Coverage Uniformitya > 95 %
On Target Percentageb > 95 %
Limit of Detectionc 0.1% (10ng input, 1,000X depth)

a : base covered at >20% of the mean coverage b : bases mapped to target regions, out of total mapped bases per run c : Tested with Horizon Multiplex I cfDNA Reference Standard Set